Изменить тег в коде

Действительно, замена тега <h3> в форме комментариев пока не предусмотрена:
https://core.trac.wordpress.org/ticket/23797

В шаблоне comments.php можно написать так:

ob_start();
comment_form( $custom_comment_form );
$comment_form = ob_get_clean();
$comment_form = preg_replace( '#<h3 (.+?)</h3>#', '<h4 $1</h4>', $comment_form );
echo $comment_form;