Проблема с сетью сайтов

Значит так:
Был сайт на самописном движке, на домене 2 уровня (предположим example.com). На субдомене этого сайта располагался блог на вордпрессе (blog.example.com). В какой то момент я решил объединить эти 2 сайта под 1 движок вордпресс путем создания сети сайтов. Так как вордпресс уже был установлен на субдомене, то создать сеть было не просто, нужно сначала избавиться от субдомена, что я и сделал вручную поиском и заменой домена по базе. После того как сеть была установлена, я создал субдомен через админку, и тем же поиском и заменой переместил все записи обратно. Основно й сайт (example.com) я переделал с самопального двига под шаблон вордпресс и установил на основной домен.

Проблема:
1. Теперь почему то в панели управления в выпадающем списке не отображается сайт на субдомене, а только основной.
2. На сайте субдомене в разделе «пользователи» не видно ни одного пользователя (хотя чуть выше имеется фраза «2 записи» но этих записей не видно). Когда создаешь новую запись, пользователя можно выбрать, и их действительно 2.
3. Установлен плагин NextGen Gallery. При входе в панель управления сайтом субдоменом сверху высвечивается надпись красным: Sorry, NextGEN Gallery works only with a role called administrator. В принципе это вроде как ни на что не влияет, единственное что заметил, теперь не работает наложение водяного знака из картинки (если делать из текста, работает).

Может кто понимает в чем проблема?