Проблеммы с Хедером сайта

Незакрытые теги или get_header() не там где нужно.

Пример index.php

<?php get_header();?>
<?php get_sidebar(); ?>
<div id="content">Тут loop и контент</div>
<?php get_footer();?>

Да и вообще выложите код header.php,index.php и footer.php, если с тегами всё правильно — значит копать в другую сторону.