Вирус внедряется для меркантильных целей, а тут просто недоступность сайта.
Что значит — недоступность? Белый экран?
Сайта? Админки?
Почему я из вас выжимаю информацию?
Будете так писать свои вопросы — ответа никогда не получите.
Neither, вот сразу ошибка из логов:
.htaccess: </IfModule> without matching <IfModule> section
Проще говоря, </IfModule> повторяется два раза.
Вирус внедряется для меркантильных целей,
Вы удивитесь, но среди вирусов тоже встречаются которые не достигают своих целей. Зато по пути могут что-то и поломать.
Кто-то или что-то добавляет в ваш штэксесс код — надо искать лишние файлы в папках.
Для начала — удалить wp-admin, wp-includes, заменить с компьютера с дистрибутива, затем проверить и заменить папки плагинов, затем просмотреть папку /uploads — там часто кроме картинок бывает лежат php-файлы, которых там априори не должно быть. Я имею ввиду папки типа 2013/03 и так далее, в корневой /uploads тоже могут лежать непонятные файлы.
Скачать плагин — gotmls, у автора плагина зарегистрироваться, дать ей 5-10 долларов, она активирует плагин по полной схеме проверки. Лучше этого плагина никто вам не просканирует всю директорию сайта и не расскажет, какая гадость там у вас хранится.