Во втором файле нашел вот такие строки кода:
function list_cats($optionall = 1, $all = 'All', $sort_column = 'ID', $sort_order = 'asc', $file = '', $list = true, $optiondates = 0,
$optioncount = 0, $hide_empty = 1, $use_desc_for_title = 1, $children=false, $child_of=0, $categories=0,
$recurse=0, $feed = '', $feed_image = '', $exclude = '', $hierarchical=false) {
_deprecated_function( __FUNCTION__, '2.1', 'wp_list_categories()' );
$query = compact('optionall', 'all', 'sort_column', 'sort_order', 'file', 'list', 'optiondates', 'optioncount', 'hide_empty', 'use_desc_for_title', 'children',
'child_of', 'categories', 'recurse', 'feed', 'feed_image', 'exclude', 'hierarchical');
return wp_list_cats($query);
…может это они отвечают за вывод виджета с рубриками? В них попробовать добавить:
<li><a....</li>
???
