В WordPress уже интегрированы библиотеки jQuery Masonry и Masonry (native Javascript). Возможно, стоит использовать их (может быть ваша ссылка это как раз тоже самое, я не очень хорошо разбираюсь в JS-библиотеках)?
Подключить любую JS-библиотеку можно с помощью wp_enqueue_script http://codex.wordpress.org/Function_Reference/wp_enqueue_script
но как подключить тогда jQuery Masonry в top-navigation меню?
Как-то так. На странице есть же примеры почитай там)
function theme_name_scripts() {
wp_enqueue_script( 'jquery-masonry');
}
add_action( 'wp_enqueue_scripts', 'theme_name_scripts' );
и куда этоn код вставлять? в header темы wp?