Ссылку на главную

Здравствуйте.

Воспользуйтесь функцией is_user_logged_in.
Пример:

<?php
if ( is_user_logged_in() ) {
    echo 'Welcome, registered user!';
} else {
    echo 'Welcome, visitor!';
}
?>

а как работать именно с ссылками, а не простым выводом строк?

А в чем затруднение? Будет аналогично:

<?php if ( is_user_logged_in() ) : ?>
    <a href="/wp-admin/profile.php">Личный кабинет</a>
<?php else : ?>
    <a href="/wp-login.php">Вход</a>
    <a href="/wp-login.php?action=register">Регистрация</a>
<?php endif; ?>
?>

Все зависит от верстки конкретного сайта. В общем случае, можно разместить в наиболее подходящем месте темы, а затем скорректировать положение, например, с помощью css-свойства margin.