Автоматическое изменение статуса заказа на выполенный

Если используется какая-то автоматическая платежная система, то изменение статуса заказа должен делать плагин платежной системы. Если не делает, то либо плагин неправильно настроен, либо он неправильно написан. В обоих случаях лучше спрашивать у разработчика плагина платежной системы. А здесь вряд ли кто-то сможет угадать, что у Вас установлено и как настроено.