Прошло достаточно времени, я разобрался отчасти с задачей, может кому пригодится.
1. Так и есть WP 3.0 + активированная функция мультиблога = WP MU.
2. Тогда я упустил из виду но на том же сайте есть еще одна статья, которая почти мой случай.
В общем если кому-то нужно соединить WPMU и BP, то по этим инструкциям это можно сделать только в корне сайта. При установке в директорию WPMU этот вариант не срабатывает — в соц.сети почти везде вылезают ошибки 404.
Я на своем сайте создал субдомен и туда в корень поставил WPMU и BP (опять же) в поддиректорию, все прекрасно работает и база пользователей при этом единая.
Знаю, что есть такой плагин BP Group Categories/Types, находится он тут.
Но как пишет разработчик, пока не желательно ставить этот плагин на рабочую версию сайта, т.к. он еще очень сырой. Мне кажется это будет очень полезный плагин — сам жду когда он выйдет из тестирования