Благодарю за ответы.
Ладно, не буду усложнять себе жизнь и верну часть старых медиафайлов в папку uploads, а часть старых удалю. Пусть будет сортировка штатными средствами WordPress для новых файлов, а со старыми не буду заморачиваться.
То есть вариантов решить этот вопрос нет?
Только сбросить старые картинки снова в корень uploads?