вот это как раз и странновато, неужели нет отдельных плагинов, не связанных с товарами?
логика в том, чтоб перенести дерево категорий с одного магазина в другой.
или же во время импорта указывать свои категории, а не внешние (категории поставщика), для этого же надо предварительно составить каталог?