ta_tochka

нужно зайти в админку и выбрать пункт меню Настройки -> Постоянные ссылки и просто нажать сохранить. Так нужно делать всегда, если какие-то изменения вносите связанные с пермалинками.
У меня там в примере тоже несколько разных кастомных типов записей, массивом передаются

Проблему удалось решить. Выкладываю решение на всякий случай, вдруг кому пригодится.

function true_post_type_rewrite() {
	global $wp_rewrite;
	// в данном случае мой тип записей был - Услуги (services)
	// этот код позволит перезаписать урлы
	// параметры add_rewrite_tag('%название_тега%', '%маска_символов%', '%url_параметр%')
	$wp_rewrite->add_rewrite_tag("%services%", '([^/]+)', "services=");
	$wp_rewrite->add_permastruct('services', '%services%' );
}
add_action( 'init', 'true_post_type_rewrite');

function true_rewrite_conflicts( $request ) {
	if(!is_admin())
		$request['post_type'] = array('services', 'post', 'page', 'blog', 'doctors'); // перечисляем типы записей с подобной структурой пермалинков
	return $request;
}
add_filter( 'request',  'true_rewrite_conflicts' );

Пересохраняем пермалинки в админке wp