Обычно должно помочь. Если нет — удаляй через базу данных. Если опыта нет, просто забей на это, в настройках категории, а именно в разделе дополнительно, в поле Канонический URL-адрес впиши адрес страницы куда перенес товары, или на край адрес главной страницы, яндекс простит тебе ошибку.